I 1960 gjennomførte man den første vitenskapelige reisen til Marianergropen – det dypeste punktet på jorden (11 034 meter). Siden har ingen andre gjentatt bedriften, og havbunnen har inntil nå vært det siste store, uoppdagede området her på planeten. I "Dypets hemmeligheter" drar vi på en utrolig ekspedisjon ned i dypet – ned til jordens lengstlevende organismer, temperaturer høye nok til å smelte bly, innkapslede ferskvannssjøer og transportbånd som flytter hele øygrupper tvers over havet!